指日,烟台大学人命科学学院微生物(微藻)革新使用团队正在微生物体系学商酌界限得到首要发达,团队基于全基因组剖判初度昭着了中慢生根瘤菌属及其近源属的属级分类基因阈值,革新提出9个新属并实现15个物种的科学重分类,为微生物分类学确立了新模范。联系商酌效果已获取国际微生物体系委员会认同,并正式列入原核微生物分类名录。这一冲破性商酌为微生物分类学供给了新的科学依照,处置了永久此后困扰学术界的中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)及其近源属的分类芜杂题目。

根瘤菌是农业微生物中的首要类群,更加正在植物固氮经过中阐发着枢纽用意。然而,中慢生根瘤菌属与近源的Aquamicrobium、Pseudaminobacter等属的分类相干不断较为芜杂,多个分别属的物种正在进化树上杂沓正在沿途。因为现有的微生物分类体系缺乏属级分类的模范,这一题目急急妨害了该类群的体系学商酌和实质使用。
为处置这一困难,人命科学学院微生物(微藻)革新使用团队基于体系基因组学伎俩,修筑了叶瘤杆菌科(Phyllobacteriaceae)完全楷模菌的全基因组体系发育树。商酌团队通过剖判539个中枢卵白序列,将Mesorhizobium及其近源的4个属划分为15个簇和亚簇。通过生物消息学软件,团队从DNA和卵白层面准备了完全楷模菌间的分歧度,出现楷模菌间全基因组的均匀核苷酸划一度为77.40%至80.91%,中枢卵白均匀氨基酸划一度为83.98%至86.16%,这些数据间隔为属级分类供给了昭着的阈值。基于这些出现,商酌团队将全基因组体系发育树的15个(亚)簇分类为15个属,并提出了9个新属的筑设,同时对15个种实行了重分类商酌。

这一效果不光为微生物分类学供给了新的模范,也为联系菌株的使用商酌奠定了科学基本。该商酌为原核生物正在属级分类单位的科学分类供给了新的商酌伎俩和依照,处置了永久此后困扰微生物分类学的困难,不光推进了微生物体系学的开展,也为农业微生物的使用商酌供给了首要的表面援手。
据悉,商酌由人命科学学院李岩副教化行动第一作家兼通信作家,中国农业大学生物学院田长富教化为联合通信作家。人命科学学院孙利芹教化、硕士商酌生郭亭妍、墨西哥国立理工大学Wang En-Tao教化以及英国约克大学J. Peter W. Young教化也到场了该项使命。商酌获得了山东省天然科学基金、烟台大学科研启动基金等项宗旨援手。